不是。

当时皇上下令命人将方之航收押，把案件交给刑部处理。而方之航的妻子被人举报招兵买马，准备劫囚，后来又被怀疑劫持。所以刑部就坐实了方之航的罪。但皇上只说将方之航先押回杭州大牢，并没有下令斩首，可后来又发生了一次劫囚事件，据被抓住的人口供，那些劫囚的人都是小燕子的舅舅。于是刑部的人，就先斩后奏直接斩了方之航。所以是刑部的人下令斩首方之航的，后来皇上告诉萧剑刑部的那个人就是方式舟。