通天道人要杀白小纯的原因是：白小纯的天赋极高，通天道人想要把白小纯炼制成为自己突破永恒境界的丹药，他为了这个目的已经杀死了很多自己收的天赋异禀的徒弟，其中就有灵溪宗的前身寒宗宗主，可以说通天道人已经把白小纯当做了自己的药引子，这才想要杀死白小纯。