灰原揭破柯南身份是《名侦探柯南》第129集。

第129集 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件 

名为灰原哀的奇妙少女转学到了柯南的班级。以冷酷的态度对待步美等人的哀，只对柯南表现出兴趣。邀请少年侦探团调查事件，和柯南一起救出同班同学俊也的哥哥，解决了事件。回家的途中，灰原向柯南挑明身份，并骗他说博士已经被组织杀了。