个体工商户开票超额，要区分情况，如果个体户是按照税务机关予以核定的定额纳税，超过定额部分按照百分之三纳税税。

如果是查账征收的方式，目前是月销售额不超过十五万元（季销售额不超过四十五万）可以享受免税。但是如果超过就要全额按照百分之三缴纳增值税，而不是仅就超过部分纳税。