外形不同：高山黄杨和小叶黄杨虽然都是黄杨，但看名字就知道叶子的大小不一样。前者的叶子在4-8厘米左右，很少的可以长到9厘米，宽一般为1.5-3厘米。后者的叶子则要小得多，长度不足1厘米，宽只有5-7毫米。

它们的枝条也有区别，高山黄杨小枝为四棱形，表面光滑无毛，小叶黄杨的小枝上有短柔毛。