牡丹属于直根系，生长期间根系可以深达地下2米，根肉质，宜干不耐水湿。而且牡丹花的根系特别发达，根粗、多而且较直。因此要选用深盆。不同的株形所选用的花盆大小不一样，1-2枝的牡丹一般用16-24厘米直径的盆，3-4枝牡丹则用24-30厘米直径的盆，5-6枝牡丹可以用30-36厘米直径的盆。