武动乾坤中的九天太清宫结局是被元门三大掌教联合域外邪魔覆灭了，这也让九天太清宫的圣女绫清竹放弃了自己已经拥有的元力，改修九天太清宫的镇宫功法《太上感应篇》，进过几年就成功的练到小成，最终成功覆灭了元门和三大掌教，为九天太清宫复仇成功。