区别一、释义不同

司仪：一指官名二指举行典礼时报告进行程序的人三指举行典礼或大会时报告进行程序。

牧师：新教的一种神职人员，负责教徒宗教生活和管理教堂事务。

区别二、引证出处不同

司仪：陈残云《山谷风烟》第三九章：“他代表工作队，按着主席团的布置，负责大会的司仪。”

牧师：汉典。