飞鱼的天敌有很多。它本身只能长到60厘米左右，比它大的肉食性鱼类都会吃它，虽然它的速度很快，但总有更快的，比如旗鱼、剑鱼和金枪鱼，这些鱼类的速度是超过它的，因此捕食也非常容易。除了水里的，天上的很多鸟也会以鱼为食，比如海鸥就会吃它。当然，对它而言，最可怕的敌人还要数人类。