秦时明月中的马其顿方阵结局是被蒙恬全歼了，虽然一开始和马其顿方阵交手蒙恬的火骑兵损失惨重，但是在蒙恬调来了奇门遁甲的大型弩机之后，就大破马其顿方阵，之后他的骑兵就大杀四方，成功的全歼了马其顿方阵，可以说获得了全面的胜利。