两个词的区别在于，乘虚而入的意思是乘着虚弱疏漏的时候进入。也比喻指军事上向对方没有设施或兵力薄弱的地方进攻。乘其不备的意思是指利用别人没有防备的时机，去侵害对方。比如说，如果平时不注意锻炼身体，抵抗力一差，病菌就会乘虚而入。