神雕侠侣中的全真教以及全部教徒，是在后来蒙古大军攻打全真教，重阳宫大战蒙古大军放火烧了终南山，全真教的全部教徒都撤走了，蒙古大军等于是灭了全真教，也就是说全真道人是被蒙古大汗收服了，从此以后也没有了全真教的存在，因为重阳宫变成了一片废墟。全真教以及教徒也不敢再重返终南山。