两次

1、嘉庆帝第一次南巡在1791年，准备工作早一年就着手进行，由一位亲王督办此事，勘察路线，整修名胜，兴建行宫。

南巡路线确定为：渡黄河后乘船沿运河南下，经扬州、镇江、常州、苏州、嘉兴至杭州。

2、1798年年正月，嘉庆帝奉皇太后起銮出京，开始第二次南巡。

南巡路线为：天妃闸，苏州，杭州、徐州等地。