重整旗鼓和卷土重来都是指失败后重新来过，但还是有区别:

重整旗鼓是失败后在重新整合资源和人马以及资金等等条件，准备重新发动实力实现目标和任务。

卷土重来指失败后休整，招兵买马以及其它方式让自己实力壮大，在重新出发完成以前的心愿。