微信好友的评论消失是因为对方已删除。

朋友圈发布的内容以及点赞和评论是保存在服务器上的，除了发布者以外，其他人都无法对已经发布的内容进行删除。发布后，好友可以点赞或者取消点赞，可以评论或者删除自己发出的评论，不能删除别人发出的评论，包括朋友圈内容发布者本人。

一旦发布者将发布的内容删除，服务器上也会同步删除，再查找也不能找回进行显示了，而评论的内容，也是只有评论发表者本人才能删除，删除后也不再显示。