芭芭农场合种后原来的树会暂时封存。

如果你与他人合种前，有自己单独种植的果树，你的果树会被暂时封存。直到你们合种的果树成熟或者你退出合种的队伍，你原来的果树才会解封。进度肯定也还是你合种之前的进度。

再说一点，如果你中途退出了合种队伍，那么你之前在合种果树上浇灌的肥料，会在次日按比例退还。