东欧牧羊犬颜色为黑褐色和灰色，标准颜色包括黑色和明亮部分(眼睛、爪子、颧骨和尾巴上方的标记)，黑色和浅灰色，但也可能出现区域性红色。

东欧牧羊犬的毛发是双色的，内层由厚实柔软的里料组成，浅色半透明，外层颜色较深。颈部和臀部有丰富的长毛头部、前腿和爪子的表面应尽可能短。