一番打斗，正义战胜了邪恶，天下太平。 三件魔器中的两个交给了清柔师太保管，回魂珠则被忆如带走救活了月如，一家回仙灵岛团圆。

《仙剑奇侠传二》的故事发生在《仙剑奇侠传》的8年之后，剧情上也有承接，围绕王小虎、沈欺霜、苏媚、李忆如四人讲述前后两代发生过以及即将发生的感情恩怨纠葛。