明朝后期军队建设有所加强，万历中期达到90万，但分布比较集中，京师周围30万，辽东20万，山西、河南北部、安徽北部共约20万，其余全国分布。崇祯年间部队数量下降至80万，但战斗力大大提高，尤其是辽东军团和京师军团。由于明朝气数已尽，君臣互不信任，阉党、权臣互相掣肘，最终战斗力最强的辽东军团总指挥袁崇焕被皇帝赐死，京师军团主力吴三桂不得不去山海关补缺。

明朝灭亡时，尚有明军50万，30万随吴三桂投降女真，20万被闯王收编后暗中杀害。