在崇祯的心里，魏忠贤一党是大明王朝的罪魁祸首和毒瘤。而东林党是跟魏党做斗争的势力，敌人的敌人就是朋友。更何况东林党的作为看起来是为国为民，需要重用，怎么会有铲除的想法呢等崇祯看清了东林党就是一个嘴炮党的面目以后，政局也都无法挽回了，也就没有铲除东林党的时间和必要了。
崇祯为什么不铲除东林党
崇祯表面上是一个皇帝，但内心却是一个儒门圣徒，有道德洁癖，也沽名钓誉，对自己名声非常重视，他害怕违背东林党的意愿会被士大夫指责和愤怒。要知道大明几代皇帝被读书人黑得有多惨，这对要立志做明君的崇祯是接受不了的。因此崇祯皇帝是不敢对东林党下手的。
崇祯为什么不铲除东林党
崇祯不铲除东林党原因是三个：
1、崇祯皇帝最早是利用东林党来打击阉党、搞垮魏忠贤的，而且在清除阉党、巩固皇权的过程中，东林党人发挥了重要的作用，换句话说，如果没有东林党人的支持，崇祯很可能搞不定九千岁魏忠贤，引来杀身之祸。所以对于东林党，崇祯是同情和支持的，这是他不压制东林党的原因之一。
2、当时东林党的势力仅次于阉党，阉党倒台后，东林党便成为明朝最大的文官势力集团，大明满朝文武，到处是东林党的人，即便崇祯想压制东林，也没有足够的施展空间，换句话说，没有人有能力来替他做这件事，靠一两个人显然是不行的。一个例子可以反应东林党人的强大，崇祯一直想增加商税来解决明朝的财政危机，但被东林党官吏直接拒绝，最终不了了之，直到崇祯自缢也没有实现。
3、“风声雨声读书声声声入耳、家事国事天下事事事关心”是东林党人的座右铭，在当时，东林党人一直占据道德的制高点，是匡扶正义、关爱苍生的代名词，比如我们熟知的杨涟、左光斗、顾宪成等，随意压制或者杀伐东林党人，道义上站不住脚，毕竟崇祯皇帝也是一个明君，滥杀无辜的事情做不出来。而且当时大明最大的危机是农民起义和后金入侵，崇祯也没有心思去压制东林党人。
