两者同科不同属，最直观区别在于嘴巴，马口鱼的嘴巴是W状。

马口鱼是一种鲤科、马口鱼属的小型鱼类，体长而侧扁，腹部圆。口裂向上倾斜，下颌后端延长达眼前缘，其前端凸起，两侧各有一凹陷，与上颌前端和两侧的凹凸处相嵌合，形如马之口。

马口鱲是鲤科马口鱲属的一种鱼类。具蓝绿色横纹。上下颌边缘略微凹凸。头后隆起，尾柄较细，腹部圆。头大且圆。