有以下区别：

第一、借调函和借用函所表示的人员工作关系不同：前者的工作关系仍不在原单位，后者的工作关系仍在原单位不变。

第二、工作时间不同：前者属于新调入单位的正式编制可长期工作。后者属临时编制，时间较短。

第三、享受的福利待遇不同：前者享有与新调入员工的正式工资及福利待遇。后者则不是。