一、指代不同

1、崽崽：需要充分营养才能长得高大伟岸的小男孩。

2、仔仔：称幼小的动物。多指牲畜等。

二、引证用法不同

1、崽崽：字从山从思（读如“腮”），思亦声。“山”指“高大”、“伟岸”。“思”本义为“考虑粮食问题”，转义为“注重营养”。“山”与“思”联合起来表示“需要注重营养使之茁壮成长的小男孩”。

2、仔仔：幼小（多指牲畜、家禽）。如：仔兽（野兽的幼仔）仔猪（猪的幼仔）。

三、侧重点不同

1、崽崽：侧重于表示牲畜幼崽。

2、仔仔：侧重于表示家族里的最小的孩子。