温铁军先生主要著有《三农问题：世纪末的反思》、《中国农村基本经济制度研究》、《八次危机》、《“三农”问题的认识误区》、《当“三农”遭遇WTO》、《半个世纪农村制度的变迁》、《我们到底要什么》 、《去依附》等。

不同于那些呆在研究室里闭门造车的“三农”问题专家，温铁军先生的论著都是通过广泛的调查研究，深入农村基层，用最真实的资料写成。用温铁军先生的话来说，他的文章都是用腿“写”出来。