主要区别：

第一，体形长短不同，刀鳅体形短，而鳗鱼体形长

第二，繁殖习性不同，刀鳅是就地繁殖，而鳗魚洄游到长河入海口繁殖

第三，保护级别不同，刀鳅非二级保护动物，而鳗鱼是二级保护动物

第四，价值不同，刀鳅的养殖的经济价值略低，而鳗鱼的养殖的经济效益略高。