海马每年的5-8月进行繁殖，和其他所有动物都不同，海马是雄性产出后代。雌海马会将卵子释放到雄海马的腹囊中，然后由雄海马为其受精，受精卵直到孵化前，会一直待在雄海马的肚子里，孵化后才会被释放出来。

海马一胎可以产好几百个小海马。在胚胎发育完全之后，雄性海马会生产。它们通过肌肉挤压，采用喷射的方式生产。它们每次可以生产的后代数量比较多，可以达到几百个。不过，这些孩子的存活率并不是特别高。若是在可以人工控制环境的情况下生产，小海马的存活率会相对高一些。