国企副总经理与总经理助理的待遇差别没有明确的规定，有些国有企业两个职务的待遇是一样的，但是，大部分的国企副总经理的待遇要比总经理助理的待遇要高，一般是副总经理的年薪昱总经理的百分之八十，而总经理助理的年薪只能是总经理的百分之六十，也就是说副总经理的待遇要比总经理助理的待遇高百分之二十。