权限不一样。

公章的作用是一个机关事业单位行使国家职权的象征和权力。如上报下发文件，必须加盖公章方可有效。

政工专用章代表一个单位的某项工作权力和使用。如，党支部专用章，工会专用章（指单位上的工会组织，妇联组织，如教育局工会）等。