小叶紫檀的萌发能力比较强，所以耐修剪，即便是截桩，通常在几天后也能快速发出嫩芽来。

只要生长条件满足，紫檀植株在每个季度都可以出现一次萌发新梢的过程，所以修枝往往一年四季都适合进行的。但每一次的修枝行为需要在新梢变壮老熟以后方可进行，而且以春秋两个季节进行修剪最为适宜。