一个是正式的行政区划单位，一般管辖着一定数量的县和区。市辖区是国家行政区划的重要组成部分。而功能区只是当地政府为了集中资源，促进区域内经济发展而单独设立的，不是正式的行政区划单位，受市辖区管辖。

市辖区和市辖功能区区别

      市辖区与市辖功能区的区别在于市辖区是行政区，是国家的一级政府，市辖功能区是为了满足某方面职能设立的区级管理机关，如高新技术开发区、经济技术开发区等。没有政府管理职能。