员工合同档案归档，如果是要归入人事档案，应将劳动合同原件提交至人事档案存档机构归档如果是公司内部档案卷宗管理，简单的方法就是按一人一档管理，将员工的证书等复印件、面试记录、录用表格、用工登记表、劳动合同等按形成时间排序，依次存入，并编写目录。