法藏寺始建于唐哀宗时期，即公元905年至907年间，初名弥陀庵，规模尚小。明代成化年间，智中一天禅师晚年来到彭州，在弥陀庵颐养天年，主持修建了名震川内外的“摇亭碑动金铃响”奇观。

此事被明成祖得知后，欣然挥毫御书“明授古刹”，赐九龙金匾，并于永乐四年将弥陀庵更名为法藏寺。