金沙江、澜沧江、怒江、元江和漾濞江（澜沧江支流）等。        主要河流属金沙江、澜沧江、怒江、红河（元江）四大水系，有大小河流160多条，呈羽状遍布大理州。州境内分布有洱海、天池、茈碧湖、西湖、东湖、剑湖、海西海、青海湖8个湖泊。

    大理州是红河的发源地，源头位于大理州巍山县永建乡米鹿么村。