石洞里的蜜蜂飞逃有以下几种原因。

一，虫害侵袭。因为石洞里的蜜蜂大部分都是野生蜂群。在野生状态下的蜂群容易受到蜘蛛，老鼠，大头蚂蚁的侵害。

二，受自然因素的影响。比如在雨季，石洞顶端淋水，蜂群无法继续居住。

三，洞口宽大，冬天寒冷而无法居住。