最好不要养。夜光藻本身无毒，但夜光藻赤潮暴发时会产生大量粘性物质，这些粘性物质可能会堵塞鱼类的鳃，造成鱼类窒息死亡，因此对水产养殖危害较大。

由于夜光藻是纯异养生物，不能产生氧气，在夜光藻赤潮发生时会大量消耗水体中的溶解氧，且夜光藻细胞死亡后被细菌降解时也需要消耗大量氧气，从而造成鱼类及其他水生生物缺氧死亡。