锡金境内多山，平坦地区很少。土地几乎都在海拔1500米以上，各地海拔差异大。全境西、北、东三面被高山围绕，如马蹄形。东部是栋基亚山脉，西部以辛加利山脉与尼泊尔为界，辛加利山脉上有世界第三高峰干城章嘉峰，海拔8586米，位于尼泊尔和印度的边界上。全境为蒂斯达河流域，蒂斯达河被视为锡金的“母亲河”。水力资源丰富，共有大小水电站21个。