这种制度是既不理也不合法，所谓旷工一天其实质就是一天没有履行请假手续而又没有来单位上班，属于一天没有工作，这一天也没有出勤记录，那么这一天也就没有工资了，然而制度规还要扣两天的工资，这就是属于用人单位克扣工资的行为，所以属于不合法。

公司规章制度旷工一天扣两天

大多数公司都是规定的旷一罚三。有事情完全可以向公司请假，只要是正当理由公司都会允许的。没有哪一家公司可以拒绝给与员工请假安排，如果确实有这样的情况完全可以找到相关部门要求处理。但是同样旷工也是完全不应该的，是违反劳动合同，劳动法的行为。