丝瓜秧本身是不分雌雄的。丝瓜花开初期以雄花为主，过一段时间会逐渐由雌花出现，比雄花大，雌蕊丰满，与雄花相比差异很明显（总体而言雄花多于雌花）。

一般由于有自然风或者蜜蜂蝴蝶之类的，可以自然授粉，不过还是提醒可以人工授粉，授粉后方能结瓜的。