国家重大项目建设指挥部是我国从70年代起，对一些规模大、工艺复杂、牵涉面广，需要各方面协作配合的重要工业建设项目，为了统一指挥和便于解决问题而在施工现场组织的有地方党委、主管部门、建设单位、设计单位、施工单位等派人共同组成的工程指挥部。

这种指挥部通常是由所在地方领导，或由所在地方和上级主管部门双重领导。指挥部的第一把手，一般也是由地方党委和主管部门的领导同志担任。