生长素可以被酶氧化降解或光氧化分解。

①酶氧化降解：吲哚乙酸氧化酶是一种含Fe的血红蛋白。IAA经酶解后形成3—羟基甲基氧吲哚和3—甲基氧吲哚。（呃，这个太复杂了）此反应要在O2存在下，以Mn和一元酚作辅助因子，吲哚乙酸氧化酶才表现活性。

②光氧化分解：X-光，紫外光，可见光对IAA都有破坏作用，分解产物也是3-亚甲基氧化吲哚和吲哚醛。但机制尚不清楚，在试管里，植物的某些色素，如核黄素，紫黄质等能大量吸收蓝光，并促进IAA的光氧化分解。