以驻地水西街得名。解放前夕，属赣县直属区水西乡。解放初属赣县湖边区水西乡、和乐乡、赤珠乡。
1950年5月20日水西乡从赣县划入赣州市，属郊区。
1951年属第五区，1952年为直属乡，1953年属第三区。
1956年属西处办事处，后属农林水利局。
1957年复属郊区，1958年并入章贡乡（又名郊区公社）。
1959年撤章贡乡，改为水西乡（公社），并将通天岩、赤珠、联三大队从赣县划入。
1968年冬与水东、白云、南桥公社合并设立市郊区公社。
1972年改名水西公社。
1984年4月改为水西乡。
1990年调整为现区划。
