雅鲁藏布江在中国境内全长1787公里。主源杰玛央宗曲，海拔5300米，在桑木张与南源库比曲汇合，称马泉河，为上有段。向东流至萨噗县的里孜后，始称雅鲁藏布江9里孜以下海拔降到约4500米以下。经拉孜、日喀则、曲水、泽当到米林，长约1340公里，是为雅鲁藏布江中游，米林以下为下游。

上游河床海拔超过3950米，中游河床高程降至3950米以下，一般仍在3000米以上，是世界海拔最高的大河。