和鼹鼠亲缘关系最近的动物是鼩鼱，它们长得更像老鼠，也没有鼹鼠那么喜欢挖洞。

鼹鼠的另一类亲戚是刺猬，从前鼹鼠、鼩鼱和刺猬一起被列入食虫目，现在新的分类方法把刺猬单独分成了猬形目，鼹鼠和鼩鼱则列为鼩形目。不过不管怎么分，这三类动物都是以无脊椎动物为主食，鼹鼠的主要食物是地下的蚯蚓和各种蠕虫、昆虫，偶尔才吃一点植物。