黑藻是真核生物，有线粒体。

黑藻属单子叶多年生沉水植物，是高等植物。

黑藻是水鳖科黑藻属植物。多年生沉水草本。茎伸长，有分支，呈圆柱形，表面具纵向细棱纹，质较脆。休眠芽长卵圆形苞叶多数，螺旋状紧密排列，白色或淡黄绿色，狭披针形至披针形。叶4-8枚轮生，线形或长条形，长7-17毫米，宽1-1.8毫米。花单性，雌雄异株雄佛焰苞近球形，绿色，表面具明显的纵棱纹，顶端具刺凸。果实圆柱形，表面常有2-9个刺状凸起。种子2-6粒，茶褐色，两端尖。植物以休眠芽繁殖为主。花果期5-10月。