区别是：红旗16防空导弹和红旗9防空导弹的不同。

红旗9防空导弹的综合作战能力虽然较强，但基本上不适应跟随陆军进行伴随防空，而红旗16虽然综合作战能力相对较弱，但能够为陆军提供伴随防空作战。可以说红旗9防空导弹是固定阵地被动的防空模式，而红旗16防空导弹是移动阵地主动的防空模式，所以红旗16防空导弹更适合部队行军时使用。