1、

定义不同: 生物种类的多样性是指一定区域内生物钟类(包括动物、植物、微生物)的丰富性，基因的多样性是指物种的种内个体或种群间的基因变化。

2、

范围不同 人类已鉴定出的物种，大约有170多万个，我国已知鸟类就有1244种之多，被子植物有3000种，即物种水平的生物多样性及其变化生物的基因也成千上万，同种生物如兔之间(有白的、黑的、灰的等)基因也有差别，每个物种都是一个独特的基因库。

3、

物种不同 生物基因多样性针对的是单一物种，生物种类多样性针对的是多个物种。