主要区别是：

一是岗位类型不同。

高级政工师岗位一般都是党群系统的岗位，如党办、工会办等部。

高级经济师岗位一般都是技术管理岗位，如财务、审计、物资管理等部门。

二是工作性质不同。

高级政工师负责编辑宣传材料、领导报告、政工系统培训等工作。

高级经济师主要负责企业内部材料、成本核算和对基层单位审计、抽查等。