湄公河干流河谷较宽，多弯道，经老挝境内的孔瀑布进入低地，到柬埔寨金边与洞里萨河交汇后，进入越南三角洲。

干流桔井以下可全年通航，桔井以上大水时可通小汽船，3000-4000吨级船可上溯至金边。通过适当整治，湄公河可成为全线通航河流。