关于马姓的血缘始祖，传统的观点认为是黄帝。黄帝与其正妃嫘祖生了两个儿子，大儿子叫玄嚣，亦名少昊，小儿子叫昌意。昌意的儿子是颛顼。帝颛顼有个孙女叫女修，因食燕子蛋而怀孕生子大业（即皋陶），大业娶少典氏女子女华为妻，生下了伯益，伯益因辅佐大禹治水有功，帝舜便赐他嬴姓，并把本族姚姓女子嫁给他为妻。因此，马姓出自嬴姓，为帝颛顼裔孙伯益之后。也就是说马姓为黄帝后裔。

    另外有一种说法，认为马姓的血缘始祖是伏羲，马姓是伏羲后裔。据上古氏族部落史研究证明，早于黄帝部族前有很多部族存在。