黄山山体主要由花岗岩组成，这种岩石呈大块却没有层次，质地坚硬，耐酸耐腐蚀，耐风化作用，但易断裂，有岩石之王的美誉。从约八亿年的震旦纪开始，海水绕过晋宁运动中形成的江南古路，从东南方进入黄山山区，黄山一带被淹入水下，有三叶虫，海龟等化石。